寻找新发传染病背后的分子开关

绝大多数新发传染病都由病原体从动物传播到人类所致,例如埃博拉、HIV、流感和新冠肺炎(Covid-19)。剑桥大学 Clare Bryant 教授正在使用 Co-Scientist 寻找当病原体跨物种跃迁时,会在人类体内引发脓毒症等严重疾病的分子开关,并探索防止这种情况发生的新方法。
在测试 Co-Scientist 时,Bryant 向它输入了一份资助申请摘要,内容是关于她在鸟类和人类中研究流感的项目,并概述了她实验室的研究问题。该工具生成并排序了一组很有前景的假设——其中一些她已经考虑过,一些则没有。那些陌生的想法最发人深省。
项目获得资助后,Bryant 又输入了完整的详细方案。后来,她在前往布鲁塞尔的火车上查看输出结果时,突然灵光一闪:“啊哈!”Co-Scientist 将一个她之前没有注意到的蛋白质排到了优先位置,而该蛋白质与她已经感兴趣的几个信号通路有关。接下来的一整周,她都迫不及待想为它补充更多数据。
回到实验室后,她又加入了未公开的材料,这些内容在 Co-Scientist 中保持保密。随着每一轮来回迭代,假设不断被细化,从候选蛋白一路收敛到她实验室可以重点研究的具体氨基酸。
Bryant 的团队现在正在构建含有这些氨基酸突变的细胞系,以验证这些更精确的假设。她说,通常要花两到三年实验工作,才能做到识别出精确氨基酸这一步;但如果与 Co-Scientist 的合作确实把他们引向了正确的靶点,她的实验室现在有望在六个月内完成。
Co-Scientist 汇集了全部已发表文献和在线资源,帮助我提出更好的问题。它能捕捉到我在数据丰富的领域里可能会忽略的内容,并帮助我做出优先级判断,这样我的团队就能把精力集中在实验室里回答正确的问题上。
Clare Bryant 教授,
剑桥大学
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